Бактерии Fusobacterium nucleatum, обитающие в ротовой полости человека, вероятно, ускоряют рост раковых клеток в организме и затрудняют лечение онкологических заболеваний. Исследователи составили генетическую карту этих бактерий.
В недавней публикации Центра исследования инфекций имени Гельмгольца (HZI) поясняется, что Fusobacterium nucleatum является важным компонентом здоровой флоры полости рта. Тем не менее, эта бактерия может способствовать развитию пародонтита. Но еще важнее то, что ее все чаще обнаруживают на клетках рака толстой кишки и рака молочной железы. По-видимому, Fusobacterium nucleatum способствует росту опухолей и препятствует лечению.
Согласно вышеупомянутой публикации, на сегодняшний день уже существуют базовые сведения о молекулярной реакции клеток хозяина на бактерии. Однако молекулярные свойства самого возбудителя, активность и механизм распространения до сих пор мало изучены.
Ученые из Института исследования инфекций на основе РНК имени Гельмгольца (HIRI) в Вюрцбурге, а также из Института молекулярной инфекционной биологии (IMIB) при Вюрцбургском университете имени Юлиуса и Максимилиана смогли совершить настоящий прорыв в этой области. Исследователи составили атлас РНК пяти клинически значимых штаммов бактерий. Благодаря этому удалось обнаружить сотни ранее неизвестных явлений в регуляции генной активности микроорганизмов и показать, как эти микроорганизмы трансформируются по мере своего роста.
Кроме того, в новом исследовании ученые впервые использовали вектор для сверхэкспрессии гена, что позволило им изучить функции генетического материала бактерии.
Инициатором исследования стал профессор Йорг Фогель, директор центра HIRI. Результаты работы были опубликованы в журнале “Nature Microbiology”.
Профессор Фогель уверен, что эти результаты могут стать основой для новых трансляционных исследований — то есть, исследований, направленных на практическое применение в медицине.
Согласно релизу, проведенное картирование РНК охватывало Fusobacterium nucleatum с ее подвидами nucleatum, animalis, polymorphum и vincentii, а также Fusobacterium periodonticum. Команда составила атлас первичных транскриптомов — наборов молекул РНК — этих штаммов. Для изучения их генетических функций ученые использовали вектор сверхэкспрессии. Это инструмент, который "включает" определенный ген, что позволяет детально изучить механизм его действия. С помощью этого инструмента исследователи смогли обнаружить малые РНК и доказать, что они выполняют регуляторную функцию у микроорганизмов.